根据相关要求，创新中心设置共建委员会、技术委员会，下设矿山突涌水防治及地下水地表零排放关键技术研发室、矿山渗漏尾矿库垂向防渗关键技术研发室、矿山隔水层修复与再造关键技术工程化研发室、矿山堵水帷幕技术体系研发与应用示范中心、中心实验室和综合办公室。
